¿Qué puedo hacer para el acortamiento de la cadena trasera en especial los isquiotibiales?

Me duelen a menudo los isquios, tanto de pie como sentada. Hago estiramientos suaves y al día siguiente me duelen más. De hecho, cuando hago ejercicio tengo agujetas. Me gustaría saber a qué se debe y qué puedo hacer para mejorarlo.

El tipo de ejercicio que suelo hacer es yoga o pilates, un par de veces a la semana, bastante suave, unos 25 minutos cada sesión. He descubierto hace poco que el colágeno tomado como suplemento me ayuda bastante a reducir el dolor, pero me gustaría no tener que depender de fármacos, ni suplementos naturales, ni cremas.

Siempre he sido un poco elástica pero la situación ha ido empeorando con el paso de los años. Lo mismo la zona de la cadera, me cuesta muchísimo todo lo que son posturas de apertura y flexibilidad de cadera en yoga por ejemplo. En épocas de más días a la semana de ejercicios y estiramientos, la mejoría (de flexibilidad) ha sido Mila y siempre se agrava el dolor.