Tengo dolor en la zona externa de la rodilla al correr ¿Qué puedo hacer?

Tengo dolor muscular cercano a la cabeza del peroné, detrás de la rodilla izquierda, del lado externo. Comenzó hace 4 días cuando salí a correr, a la media hora empezó a dolerme, seguí hasta que en un momento no podía más y empecé a caminar. Ahora me duele cuando me levanto después de estar mucho tiempo sentado y a veces al caminar.
Me da la impresión que es una consecuencia de estar muchas horas sentado en una silla muy baja (6 a 7 horas diarias). Es como si todos los músculos estuviesen acostumbrados a estar contraídos y cuando salgo a correr no tienen la suficiente elasticidad. Además, por momentos me duele un músculo o tendón que es como si estuviese en toda la parte lateral de la pierna izquierda y conectará la zona "rodilla con cadera". ¿Qué puedo hacer?